ensembl数据库(ensemble数据库与ncbi区别)

如何利用数据库查询细胞某基因表达情况

一个良好的开端就是分析感兴趣基因的突变和其它异常，ICGC数据门户提供了几条研究路线。输入一个基因名称，NCBI登录号，或者Ensembl基因ID，点击基因报告（Gene Report），就能在突变摘要（Mutation Summary）中找到已发现的突变和拷贝数变化，以及迄今为止，这些突变在肿瘤中出现的频率。COSMICsection就在体细胞突变列表下方，包括了点突变，少量缺失，以及插入突变等方面的数据。

tarbasev.8数据库使用方法

根据给出相关的文献，组织类型，检验的方法等数据可以检验数据库。

可以同时输出miRNA和gene,也可以只输入其中一种进行检索。输入的miRNA名称需要符合mirBase数据库中的miRNA名字的格式，对于gene,支持genesymbol和ensemblgeneID两种格式。

蛋白质分子量在什么数据库查?

NCBI上可以查分子量，还有其它的方也可以查。我推荐几个吧：

Genecards:

gentlas:genatlas.medecine.univ-paris5.fr

Uniprot:

如果不够用，你联系我我帮你查吧。

求基因表达常用数据库

IARS2-003指isoleucyl-tRNA synthetase 2基因003转录本。

ENST00000490891是IARS2-003的transcript ID，OTTHUMT00000090763是另一个数据库对同一转录本的编号（Havana transcript）。

;g=ENSG00000067704;r=1:220267444-220321380;t=ENST00000490891

UCSC Microarray Expression Data 给出了基因mRNA在人类不同组织中的表达量

;hgg_prot=B2RPG8hgg_chrom=chr1hgg_start=220267454hgg_end=220321376hgg_type=knownGenedb=hg19hgsid=193781719

GEO数据库给出了详细的基因mRNA在不同组织中的表达数据，

基因的表达量不等于转录本的表达量，特定转录本IARS2-003的表达量需要自行实验证明。