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moe对接不成功
moe对接不成功 方法如下,MOE分子对接教程
1.在MOE窗口open打开一个有小配体的蛋白(PDB或moe文件)点击Compute→prepare→Protonate3D(使质子化)点击OK。打开SEQ面板删去水分子和与小配体无关的其他杂配体或离子在MOE窗口右边点击SiteView点击System,改变配体颜色使得小配体显示绿色C骨架在MOE窗口点击Surface→recepter在MOE。
接下来对接一个小配体点击Compute→dock在Recepter选项选择Recepter+Solvent其它选择默认值。点击Run。在表单你会看到有不同的构象对接结果,包括RMSD值。
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